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（3）職能部門和公司分離性機(jī)構(gòu)。科研事業(yè)單位在設(shè)立內(nèi)部職能部門，負(fù)責(zé)成果轉(zhuǎn)化管理職能的同時(shí)，設(shè)立獨(dú)立全資國(guó)有企業(yè)，由企業(yè)開(kāi)展知識(shí)產(chǎn)權(quán)托管、運(yùn)營(yíng)、孵化、投資等活動(dòng)。該類機(jī)構(gòu)有利于實(shí)現(xiàn)“管辦分離”，強(qiáng)化專業(yè)人才隊(duì)伍，但可能因管理人員的不同隸屬關(guān)系不利于協(xié)同推進(jìn)。

無(wú)論采取哪種類型的技術(shù)轉(zhuǎn)移部門建設(shè)方案，科研事業(yè)單位均需要建立內(nèi)部管理制度，對(duì)科技成果轉(zhuǎn)化的凈收入，在對(duì)完成、轉(zhuǎn)化科技成果做出重要貢獻(xiàn)的人員給予獎(jiǎng)勵(lì)和報(bào)酬后，提取一定比例用于支持本單位科技成果轉(zhuǎn)化專門機(jī)構(gòu)的運(yùn)行發(fā)展以及人員獎(jiǎng)勵(lì)。

科技成果轉(zhuǎn)化是涉及知識(shí)產(chǎn)權(quán)、投資融資、技術(shù)管理、營(yíng)銷推廣等各領(lǐng)域知識(shí)的綜合性活動(dòng)，科研事業(yè)單位內(nèi)部技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)往往偏重于戰(zhàn)略規(guī)劃、制度建設(shè)、業(yè)務(wù)流程等管理活動(dòng)。《促進(jìn)科技成果轉(zhuǎn)化法》規(guī)定，國(guó)家設(shè)立的研究開(kāi)發(fā)機(jī)構(gòu)、高等院校可以委托獨(dú)立的科技成果轉(zhuǎn)化服務(wù)機(jī)構(gòu)開(kāi)展技術(shù)轉(zhuǎn)移。《國(guó)務(wù)院關(guān)于印發(fā)〈國(guó)家技術(shù)轉(zhuǎn)移體系建設(shè)方案〉的通知》也提出，鼓勵(lì)各類中介機(jī)構(gòu)為技術(shù)轉(zhuǎn)移提供知識(shí)產(chǎn)權(quán)、法律咨詢、技術(shù)評(píng)價(jià)等專業(yè)服務(wù)。

對(duì)于高校來(lái)說(shuō)，《教育部辦公廳關(guān)于印發(fā)〈促進(jìn)高等學(xué)校科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化行動(dòng)計(jì)劃〉的通知》提出，整合校內(nèi)各類技術(shù)轉(zhuǎn)移、轉(zhuǎn)化機(jī)構(gòu)，促進(jìn)高校技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)與市場(chǎng)化第三方技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)在信息、人才、孵化空間、技術(shù)轉(zhuǎn)移平臺(tái)載體等方面的共享、共建力度，形成集對(duì)接市場(chǎng)需求、促進(jìn)成果交易、投融資服務(wù)等為一體的科技成果轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化服務(wù)體系。

因此，科研事業(yè)單位在加強(qiáng)內(nèi)部專業(yè)化技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)建設(shè)的同時(shí)，有必要與市場(chǎng)化機(jī)構(gòu)建立聯(lián)合關(guān)系，強(qiáng)化知識(shí)產(chǎn)權(quán)、投資融資、技術(shù)管理、營(yíng)銷推廣等方面的服務(wù)能力。

市場(chǎng)化技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)根據(jù)其業(yè)務(wù)范圍確定盈利模式，通常通過(guò)為技術(shù)研發(fā)、轉(zhuǎn)讓、許可等技術(shù)轉(zhuǎn)移或成果轉(zhuǎn)化提供咨詢或服務(wù)，或通過(guò)載體建設(shè)、服務(wù)換股、孵化投資等活動(dòng)，收取費(fèi)用。

（1）開(kāi)展知識(shí)產(chǎn)權(quán)運(yùn)營(yíng)、市場(chǎng)行業(yè)分析等，收取服務(wù)費(fèi)。

（2）幫助科研成果進(jìn)行中試放大和熟化處理，收取相應(yīng)的服務(wù)費(fèi)用；

（3）開(kāi)展項(xiàng)目孵化、科技園區(qū)運(yùn)作等服務(wù)活動(dòng)，獲得服務(wù)回報(bào)；

（4）通過(guò)項(xiàng)目融資，以服務(wù)換股方式在股權(quán)增值變現(xiàn)過(guò)程中，獲得服務(wù)回報(bào)。

不同的技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)根據(jù)自身的特點(diǎn)和市場(chǎng)定位，可能會(huì)采用一種或多種盈利模式的組合。技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)的收費(fèi)方式也會(huì)根據(jù)服務(wù)的性質(zhì)、復(fù)雜度、市場(chǎng)行情以及與客戶的具體協(xié)議來(lái)確定。