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一是加強(qiáng)對(duì)社會(huì)資本參與新型研發(fā)機(jī)構(gòu)建設(shè)的激勵(lì)，厘清營(yíng)利和非營(yíng)利性的關(guān)系。首先，政府對(duì)新型研發(fā)機(jī)構(gòu)應(yīng)區(qū)分非營(yíng)利性和營(yíng)利性的考核指標(biāo)。非營(yíng)利性指標(biāo)應(yīng)包括共性技術(shù)攻關(guān)與服務(wù)技術(shù)能力的評(píng)價(jià)，具體包括對(duì)整個(gè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)提升的覆蓋面和改進(jìn)度、對(duì)基礎(chǔ)研究的引領(lǐng)作用、產(chǎn)生的社會(huì)效益以及人才培養(yǎng)等方面；營(yíng)利性指標(biāo)包括解決市場(chǎng)實(shí)際技術(shù)需求、孵化企業(yè)的數(shù)量和質(zhì)量、撬動(dòng)社會(huì)資本、帶動(dòng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展形成區(qū)域創(chuàng)新生態(tài)、產(chǎn)業(yè)鏈創(chuàng)新鏈強(qiáng)鏈補(bǔ)鏈等具體指標(biāo)。綜合考量非營(yíng)利性與營(yíng)利性指標(biāo)，形成新型研發(fā)機(jī)構(gòu)的綜合評(píng)價(jià)體系，鼓勵(lì)社會(huì)資本獲得營(yíng)利性運(yùn)營(yíng)過(guò)程中產(chǎn)生收益的分紅。其次，社會(huì)主體積極參與新型研發(fā)機(jī)構(gòu)非營(yíng)利性建設(shè)的，給予其享受進(jìn)口科研用儀器設(shè)備、加計(jì)扣除、固定資產(chǎn)折舊等稅收優(yōu)惠，相關(guān)的研發(fā)后補(bǔ)助、風(fēng)險(xiǎn)投資補(bǔ)貼、高層次人才引進(jìn)以及財(cái)政獎(jiǎng)勵(lì)等政策支持。最后，優(yōu)化科研團(tuán)隊(duì)的激勵(lì)機(jī)制，孵化企業(yè)中科研團(tuán)隊(duì)占股比例應(yīng)以獲得公司控制權(quán)為原則，增強(qiáng)社會(huì)資本對(duì)于科研團(tuán)隊(duì)的信任度，該股權(quán)結(jié)構(gòu)有利于提高社會(huì)資本參與的積極性。

二是優(yōu)化新型研發(fā)機(jī)構(gòu)運(yùn)行模式，“管辦分離”激發(fā)市場(chǎng)活力。功能型平臺(tái)機(jī)構(gòu)運(yùn)行模式可探索如圖2所示的結(jié)構(gòu)，管理端形成平臺(tái)管理團(tuán)隊(duì)撬動(dòng)國(guó)有重資產(chǎn)的組織架構(gòu)，由國(guó)資下設(shè)全資子公司（國(guó)有企業(yè)）與平臺(tái)管理團(tuán)隊(duì)共同持股成立新的平臺(tái)運(yùn)營(yíng)公司（有限責(zé)任公司），管理團(tuán)隊(duì)控股平臺(tái)運(yùn)營(yíng)公司。國(guó)資下設(shè)的全資子公司持有平臺(tái)的國(guó)有重資產(chǎn)，防止國(guó)有資產(chǎn)流失；平臺(tái)運(yùn)營(yíng)公司成為市場(chǎng)化窗口，輕資產(chǎn)運(yùn)營(yíng)提高靈活性，激發(fā)平臺(tái)管理團(tuán)隊(duì)積極性，國(guó)資不直接管理初創(chuàng)企業(yè)，解決平臺(tái)目前受到國(guó)資強(qiáng)監(jiān)管的問(wèn)題。投資端與管理端在組織架構(gòu)上進(jìn)行分離，通過(guò)市場(chǎng)化運(yùn)營(yíng)的方式進(jìn)行鏈接，根據(jù)財(cái)政部文件（財(cái)建〔2015〕1062號(hào)），現(xiàn)有功能型平臺(tái)原有財(cái)政資金“退坡”以后，后續(xù)財(cái)政資金可以采用政府引導(dǎo)基金方式，引導(dǎo)民營(yíng)資本，由市場(chǎng)化基金管理公司共同成立創(chuàng)新投資基金，平臺(tái)運(yùn)營(yíng)公司和市場(chǎng)化基金管理公司合作管理和投資科技初創(chuàng)企業(yè)，即財(cái)政資金引導(dǎo)社會(huì)資本投入超天使階段的科技初創(chuàng)企業(yè)。圖2所示的平臺(tái)機(jī)構(gòu)組織模式從管理端和投資端都做到了“管辦分離”，起到了國(guó)有資產(chǎn)保值增值、激發(fā)平臺(tái)團(tuán)隊(duì)活力、社會(huì)資本放大財(cái)政資金效應(yīng)的作用。

三是加強(qiáng)新型研發(fā)機(jī)構(gòu)研發(fā)與轉(zhuǎn)化服務(wù)體系建設(shè)，提升對(duì)產(chǎn)業(yè)共性技術(shù)服務(wù)的能力。提高新型研發(fā)機(jī)構(gòu)識(shí)別產(chǎn)業(yè)鏈關(guān)鍵環(huán)節(jié)、關(guān)鍵技術(shù)的能力，聚焦支持產(chǎn)業(yè)共性、單個(gè)企業(yè)無(wú)力承擔(dān)的重大技術(shù)研發(fā)，整合行業(yè)龍頭企業(yè)形成創(chuàng)新共同體，對(duì)于多個(gè)企業(yè)共同參加的產(chǎn)業(yè)關(guān)鍵共性技術(shù)研究給予優(yōu)先資助，對(duì)于排他性技術(shù)研究則由企業(yè)自行承擔(dān)費(fèi)用。完善與第三方專業(yè)服務(wù)機(jī)構(gòu)的合作模式，發(fā)揮新型研發(fā)機(jī)構(gòu)技術(shù)優(yōu)勢(shì)，與第三方平臺(tái)在金融、法律等方面形成專業(yè)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。強(qiáng)化雙向鏈接人才支撐，完善技術(shù)經(jīng)理人和中試產(chǎn)業(yè)化技術(shù)人員的管理和培訓(xùn)機(jī)制。